这本书也是由汤米讲述，比前面的《德利特医生自月球归来》晚二十年才出版，故事接续着发展。

鹦鹉玻里尼西亚与助手汤米发现医生的研究似乎进展得不是那么顺利，而非常担心。医生的研究是将月世界带回来的植物种子种植在地球上，想让人类短暂的生命能永远幸福快乐；但是研究却遇上了瓶颈，医生看来非常烦恼。

汤米、玻里尼西亚及聪明的豆豆都希望医生能改变研究目标；他们认为医生不出去旅行的话，健康可能会出问题。这时汤米突然想起那只见过诺亚洪水的长寿乌龟，若是去问牠长寿的秘诀，一定会对医生的研究有帮助。对于在前面的「邮局」之旅时，医生不是曾经将乌龟说的话记在棕榈叶的笔记上吗？

于是医生的动物家族们，便立刻前往图书馆，去找那本由白老鼠所保管的棕榈笔记。

但是这本重要的「文献」却消失了。后来小白才知道，这本笔记被国外来的老鼠咬得粉碎，拿去做床了。

大家既失望又愤怒。勇敢的麻雀奇普塞多，便悄悄地与妻子去非洲旅行，找到了那只乌龟；但是在三个月前，那儿发生大地震，乌龟独自被埋在地底的洞穴中。

德利特医生为了要救这只高龄七万岁的珍贵大乌龟，立刻起程前往非洲。

从非洲开始的医生寻找大乌龟之旅，还有大乌龟讲述的「太古大洪水物语」，是「德利特医生故事集」十二册中的高潮。

带领医生一行人前往埋着乌龟的裘卡尼克湖的，是麻雀奇普塞多与妻子贝奇。住在非洲的鳄鱼们，全部由水中爬上陆地来帮医生。在《德利特医生非洲行》中，医生的妹妹莎拉曾为了他将一只鳄鱼留在家中而愤怒地说：「我没办法再待在这个家里，我要去结婚。」便离家出走了。但是那次事件的主角，鳄鱼吉姆，却在多年后邀集自己的伙伴们来帮助医生。

这群鳄鱼及所救出来的大乌龟所说的，都是些异想天开的古老古事。现在就让我们来介绍一下在这一集中所出现的一些人物。

曼修兹王是古时候的大王，他所拥有的夏尔巴城市是全世界最有钱的都市。大乌龟说，由于曼修兹王不敬畏神明，且酷爱战争，所以才会引发圣经中所说的「诺亚大洪水」。当时诺亚是个都市的官员，同时也担任国王动物园的饲养股长。乌龟被捕后，就被送进动物园内饲养，因而结识诺亚老人与他的助手爱华。爱华是国王的奴隶，对动物非常有爱心。发生诺亚洪水时，陆地上所有的生物都快要灭顶之际，只有被放入「方舟」中的人类与动物得以倖免。此时快要淹死的奴隶爱华与他的朋友，少女嘉莎，被乌龟及牠的妻子发现。乌龟违反诺亚的命令，救了他们；因为乌龟夫妇觉得国王虽然有罪，但是这些做奴隶的少年少女有什么罪呢？大乌龟与牠的妻子对这两个无依无靠的小孩所付出的感情，非常令人感动。

当大乌龟从洞穴中被救出来，并讲完这个古老的故事之后，大家就送牠回去故乡。当牠经过河川，来到湖泊的某处，吓得停下了脚步，因为以前那个曼修兹王所统治的都市废墟浮上了水面；之前这个废墟一直被埋在地底下，乌龟不知道三个月前的大地震让它又浮了起来。于是，乌龟带领着一行人来到曼修兹王的地下宝库。

这个宝库中放满了以前全世界的金银珠宝，就这样被原封不动地保留下来，其中有珍珠、钻石，还有像蛋一样大的红宝石。他们还看到了曼修兹王的豪华「世界王冠」。管家达普哀求德利特医生，一定要将这王冠带回去，但是医生仍然像以往一样表示不愿意偷窃宝物而拒绝了。他只将曼修兹王平常所戴上面刻有当时文字的青铜王冠带回去做纪念。

医生一行人与大乌龟分别的时刻终于来临了。说完再见后，大家都不放心让生病的乌龟自个儿孤零零地回到湖中，每个人心情都很沈重。但是一行人与乌龟分别后没多久，就碰到了刚从非洲赶回来的乌龟太太。牠就像人类的老祖母一样，有些害羞地对医生说：「每当我一想到爱华与嘉莎在美国子孙们，就会非常想念他们，所以常常跑去看看。」送走了要赶回家的乌龟太太之后，医生与动物们立刻恢复了元气，朝着英国的巴德鲁比快速驾船回去。