观念生物学4:共生.平衡.互利(全新修订版)

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原文作者: Cynthia Needham, Mahlon Hoagland, Kenneth A. McPherson, Bert Dodson
图书标签:
  • 观念生物学
  • 共生
  • 平衡
  • 互利
  • 生物学
  • 进化
  • 生态学
  • 生命哲学
  • 系统思维
  • 全新修订版
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具体描述

  ●生物学家、画家、科学作家、媒体传播人联手出击
  ●图文并茂,带你探索神祕的微生物世界


  原来,微生物有另外一面,这些隐形的小家伙不全是善类。
  有些病菌就是喜欢找碴,给我们带来各种疾病。
  这场人菌大战已打了好几万年,
  随着科学与医疗的进步,战况也愈演愈烈。

  人类好不容易在二十世纪发现了抗生素,取得优势,
  但微生物紧接着就发展出抗药性来对付。
  究竟我们有没有办法战胜微生物?书中有独到的见解。

  随着对微生物愈来愈了解,我们渐渐进入与微生物合伙的新关系,
  利用它们的技能来解决种种难题,
  例如治疗与预防疾病、餵养愈来愈庞大的人口、清理污染的环境。

  然而,在开发利用微生物之际,
  我们也必须以无比的智慧拿捏好分寸,
  和这群小东西保持和谐平衡的共生关系。
  我们怎样对待微生物,关系着人类与地球的未来。

强力推荐

  这真是一套精采的书,
  用这么吸引人又容易了解的方式,
  把微生物的奇妙天地呈现出来。
  搭配了充满创造力又富启发性的插图,
  更是增色不少,连细菌也活灵活现、人模人样了!
  每个人都应该读读《观念生物学3、4》!
  ——戴维斯(Julian Davis),美国微生物学会前会长

  能把科学用这么清楚又有趣的方式介绍给大众,
  实在相当少见!⋯⋯
  作者以吸引人的实例、富启发性的比喻、
  以及引人深思的问题,来介绍书中的内容。
  《观念生物学3、4》真是一本通往一整座奇妙王国的护照。
  ——谢克特(Moselio Schaechter),《有菇为伴》作者

  ●顶尖高中推荐阅读书单
  ●大学生物课程指定教材
 
探秘生命深层逻辑:一部聚焦进化适应性与生态网络构建的全新著作 书名:《进化适应的动态图景:从基因到生态系统的复杂性》 核心主题: 本书旨在深入剖析生命系统在面对环境压力时所展现出的精妙适应机制,并构建一个涵盖分子遗传、个体行为、群体生态乃至宏观生物地理学的统一分析框架。它着眼于生命系统内部的动态平衡、信息流动以及在时间维度上的演化路径,而非侧重于特定共生关系的详细案例分析。 --- 导读:重构理解生命适应性的底层逻辑 在生命科学的宏大叙事中,我们习惯于将焦点置于物种的诞生、生存竞争与环境选择。然而,适应性并非一个静态的标签,而是一个持续的、多尺度的动态过程。《进化适应的动态图景:从基因到生态系统的复杂性》 这部著作,正是尝试跳出单一视角的限制,构建一个更加宏观、更具系统性的理解框架,来解释生命如何在不断变化的世界中维持其结构与功能,并最终实现其演化上的成功。 本书的核心驱动力在于探究“适应的机制”与“适应的边界”。我们不再将适应视为物种对当前环境的完美契合,而是将其视为一种持续调整、信息反馈和资源重分配的内在算法。 第一部分:分子基础与表型可塑性——适应的微观引擎 本部分将从基因组学和发育生物学的角度,揭示适应的起点与基础。我们深入探讨的重点在于“表型可塑性”——即同一基因型在不同环境条件下能够产生不同表现型的能力,这被视为进化的“原材料库”。 第一章:基因组的适应性重构与调控网络 重点阐述非经典遗传学在适应中的作用,包括表观遗传修饰(如DNA甲基化、组蛋白修饰)如何快速地在世代间传递环境信息,从而实现对短期环境波动的“预适应”。我们将分析基因调控网络(GRN)的模块化特征,解释为何某些关键基因模块的微小变异能引发显著的形态或生理变化,以及这些网络是如何在进化压力下被优化以提高反应速度和可靠性。书中将详细论证基因组中的“适应性潜力区”与“保守区”的划分原则,及其在不同时间尺度上的演化速率差异。 第二章:发育塑性与异速生长:塑造形态适应性的时间轴 本章聚焦于发育生物学如何“编码”环境反应能力。我们将运用异速生长理论(Allometry)来量化不同形态特征(如体型、器官大小)对环境信号(如营养、温度)的敏感程度。通过对发育约束(Developmental Constraints)的深入分析,探讨哪些适应性路径是“容易实现”的,哪些则因为固有的发育限制而难以达成。特别地,本书将引入“发育敏感性指数”的概念,用以评估一个物种在环境变化中,其核心功能是否易于被发育过程所破坏或重塑。 第三章:生理韧性与稳态调节的阈值理论 适应不仅是结构上的变化,更是生理功能上的维持。本章讨论生命系统如何通过内部稳态机制应对外部干扰。我们关注的核心是“生理阈值”——系统开始发生不可逆损伤或功能崩溃的点。通过热力学和非线性动力学模型,分析生物体在能量分配、氧化应激响应和胁迫反应中的最优策略。重点探讨细胞级和器官级如何通过冗余设计(Redundancy)来增强整体的生理韧性。 第二部分:群体动态与信息传递——适应的群体实现 当适应性从个体层面扩展到群体层面时,信息(基因、行为、文化)的传递成为决定适应成败的关键。本部分着重于分析群体结构如何影响进化的轨迹。 第四章:群体结构与基因流的耦合:适应性扩散模型 本书将群体结构视为一个多孔介质,而非简单的混合池。我们引入了空间结构模型(如反应-扩散模型)来模拟适应性状在有限接触网络中的传播速度和空间分布。书中将对比“隔离定域化”与“高迁移率”对自然选择效率的影响,并详细分析种群边界处的遗传漂变与选择压力的博弈,解释局部适应是如何在跨区域迁移中被稀释或加强的。 第五章:行为适应与学习机制的进化反馈 行为是生物体对环境变化最快速的响应。本章将探讨学习(包括联想学习、空间记忆)如何作为一种“软性”适应机制,在基因进化尚未跟上的情况下,为群体提供生存优势。我们探讨了行为的遗传化过程——即哪些后天习得的行为会通过选择压力被整合进遗传适应的轨道中。书中将引入“文化演化”的概念,探讨非遗传信息传递在加速或减缓特定适应性状固化中的作用。 第六章:群体内相互作用的非叠加性效应 传统的适应性分析常假设个体的影响是可加的,但本书强调相互作用的非叠加性。我们将从博弈论的角度审视群体内部的合作与冲突,分析哪些群体组织形式(如等级制、分散式决策)更有利于资源利用效率的提升,进而带来更强的生态适应力。重点探讨群体规模对选择压力集中度的影响,以及群体“集体记忆”在应对周期性环境灾害中的关键角色。 第三部分:生态位构建与宏观演化——适应的边界与后果 适应的最终体现是在生态系统层面上对“生态位”(Niche)的占据和重塑。本部分将视角提升至更广阔的时间和空间尺度,审视适应的长期后果。 第七章:生态位动态:构建与占据的博弈 生态位不仅仅是被动的环境集合,更是物种主动“构建”的结果。本章分析物种如何通过改变环境因子(如土壤化学性质、微气候调节)来优化自身的生存条件,即“生态位工程”(Niche Engineering)。我们将区分“环境限定的生态位”与“行为重塑的生态位”,并论证后者如何为跨环境的快速适应奠定基础。书中将详细讨论生态位重叠如何驱动物种间的长期排斥或共存动态。 第八章:演化趋同与限制性路径:适应的收敛性与多样性 本章旨在探讨适应路径的普适性。在面对相似的生态挑战时,不同的生命谱系是否会“殊途同归”?我们将通过跨界比较生物学的数据,分析驱动演化趋同(Convergence)的深层约束力——是选择压力本身,还是由生物学基础决定的“可行形态空间”?同时,我们也探讨多样性(Diversification)的驱动力,即环境异质性如何打破趋同,维持对环境变化的整体响应能力。 第九章:长时段适应的随机性与必然性 在宏观时间尺度上,适应是不可避免的,但其具体形式充满随机性。本章将讨论“搁浅”(Stasis)现象,即物种在漫长时间内保持形态稳定的原因,并将其归因于适应性景观的“平坦化”——即环境变化速率低于物种调整速率。最后,本书将总结基因适应、行为调适和生态位构建这三个层次的互动关系,提出一个关于生命持续适应的整体性模型,强调生命世界的本质是对不确定性的持续动态响应,而非对稳定状态的完美实现。 --- 目标读者: 本书面向进化生物学、生态学、发育生物学、复杂系统科学以及遗传学的研究生、研究人员和资深爱好者。它要求读者具备扎实的生物学基础,并对定量分析方法有所涉猎。本书的价值在于提供一个整合性的思维框架,帮助读者在面对前沿的、跨学科的研究问题时,能够更清晰地定位适应过程的物理、信息和时间维度。

著者信息

作者简介

尼达姆Cynthia Needham


  波士顿大学暨塔夫茨大学微生物学副教授,美国微生物学会会士、ICAN制片公司的科学节目监制,曾任微生物学素养促进会(Microbial Literacy Collaborative’s Executive Board)会长,领导各式各样的科学教育方案,《观念生物学3、4》正是结晶之一。

霍格兰Mahlon Hoagland

  杰出的分子生物学家,美国国家科学院院士。
  霍格兰在科学上有许多成就,最重要的有:发现胺基酸活化酵素;以及发现转移RNA(tRNA),揭露了DNA携带的讯息如何转译为蛋白质的机制。
  退休后专注于科学写作与教育,与窦德生合着的《观念生物学1、2》是他的代表作。
  霍格兰于2007年辞世。

麦克佛森Kenneth A. McPherson

  科学作家、ICAN制片公司的科技节目监制,专精科学与资讯科技,也常担任这方面的顾问。
  与人合着了多本机械及应用微生物学方面的书。

窦德生Bert Dodson

  才华洋溢的画家,曾为80多本书绘制插画,也是连环漫画《核潜艇》(Nuke)的作者。
  窦德生在设计学院开课多年,教人如何画插画与素描;他还写了一本受欢迎的书《会拿笔就会画》(Keys to Drawing)。

译者简介

李千毅


  密西根大学生物硕士,曾任天下文化编辑。
  译有《观念生物学1~4》、《观念化学IV》、《现代化学II》(合译)、《金色双螺旋》(合译)等书。
 

图书目录

第三篇  危险的朋友,友善的敌人
与微生物同一个屋檐下
当朋友变成敌人
熟悉的敌人
最致命的陌生访客
护卫我们的领土
如何管制传染病的爆发
与细菌共跳一曲演化之舞

第四篇  未来的创造者
与病原微生物的抗药性作战
环境大扫除
餵养全世界的人口
与微生物合伙的黑暗面
攸关微生物与人类的未来

附录  进入分子的世界
图片来源
 

图书序言

图书试读

胃和小肠——一滩酸水和一桶酦酵液
 
胃、小肠、大肠是消化道的三大部位,各自具有独特的环境。每个部位在消化食物的过程中各有自己的角色扮演,每个部位也都有属于自己的微生物农场。
 
每天,我们的胃里上演一出出细菌大屠杀的戏码。细菌在强酸的环境中饱受翻搅与打滚之苦,仅少数细菌耐得了这种折磨。胃液中的强酸是要让存在食物与饮水中的病菌无法进入小肠和大肠,因为闯入肠道中的病菌就有机会侵入体内的组织。通常,我们得吃进十分大量的细菌,才有机会让少数的存活者在体内造成疾病。
 
对细菌而言,小肠彷彿是从致命的战场(胃)通往和乐的乌托邦(大肠)必经的一段险恶桥樑。一旦来到小肠,细菌必须能够承受胆汁的蹂躏,胆汁的作用有如清洁剂,可以将细菌撕裂粉碎。细菌在黏稠的汁液中,有如浸泡在嫩肉精里,充分的扭曲瓦解。仅有躲在菌群最内部的细菌,因为远离胆汁的侵袭而逃过一劫,顺利的进入较没有毒性的大肠世界。
 
微生物大都会
 
大肠(或称结肠)是微生物群居的大都会,至少有500到600种不同的细菌定居于此,构成人体正常菌群的一部分。我们出生后的几个小时内,这些细菌就开始聚集在大肠中,随着我们所吃的东西不同,菌群的成员种类也会变化及增加。这些益菌能供应我们维生素,例如维生素K、维生素B12、维生素B1、维生素B2等,让我们吸收利用。这些益菌在大肠中自成一个高度竞争与封闭的社群,对那些闯入此地的病菌来说,想要在此立足,还需经过一番高难度的挑战呢。
 
整个大肠就像一个大型酦酵桶,里面充满各式各样的菌群。老实说,我们的粪便几乎有一半都是细菌构成的。从人类诞生的第一天开始,这些细菌就马不停蹄的为自己的生活忙碌,致力于分解肠道中尚未完全消化的食物。小肠消化的终产物在细菌的努力下,进一步转化成更小的分子,既可自给自足,还可分我们一杯羹。
 
就拿我们吃的玉米来说,玉米里面含有很多小肠无法消化的纤维素。但大肠内有一群细菌可以制造酵素,将纤维素分解成更小的化合物,包括葡萄糖,这是其他同居的菌群和我们都可以利用的东西。

用户评价

评分

我必須承認,拿到《觀念生物學4:共生.平衡.互利(全新修訂版)》這本書時,我其實有點意外。原因是我之前對「觀念生物學」這個系列沒有特別的接觸,但這次書名裡強調的「共生」、「平衡」、「互利」這幾個字,實在太吸引我了。我一直認為,生物界裡的智慧,很多都體現在這些看似簡單卻又極其奧妙的關係裡。尤其是在「共生」的部分,我總是很好奇,兩個完全不同的物種,是如何從競爭關係演變成互相幫助,甚至缺一不可的。我希望書中能夠提供一些精彩的案例,讓我大開眼界,比如一些我不知道的微生物共生,或是植物和動物之間奇妙的合作。再來是「平衡」,這是我認為生態系統中最令人著迷的部分。一個健康的生態系統,就像一個精密的鐘錶,每個齒輪都有它存在的意義,缺一不可。我希望這本書能幫我理解,這種平衡是如何形成的,以及它又是如何被破壞的。從生物學的角度來看,如何維持這種動態的平衡,這對我們理解整個地球的運作有著非常重要的意義。最後,「互利」這個概念,我認為是這本書的核心。我希望作者能夠深入探討,生物之間的互利行為,背後究竟是怎樣的演化驅動力?是單純的利益交換,還是有更深層次的演化策略?我期待能從書中學習到,如何在複雜的生物世界裡,找到和諧共存的智慧,甚至能將這些智慧應用到我們人類社會的發展和問題解決上。

评分

老實說,我對這本《觀念生物學4:共生.平衡.互利(全新修訂版)》原本沒有抱持太大的期望,畢竟「觀念生物學」這個系列,我之前讀過幾本,覺得內容比較偏向教科書式,雖然紮實,但總覺得少了點驚喜。然而,這次的「全新修訂版」聽起來好像有點不一樣,所以還是買來看看。我對「共生」這個概念其實是很有興趣的,畢竟我們人類社會也是一種共生,但生物界的共生,有時候真的比我們的社會還要複雜和奇妙。我比較好奇的是,作者這次會不會針對一些比較冷門的共生現象做深入的探討?像是某些寄生蟲如何演化出與宿主長期共存的策略,甚至對宿主有利的情況,這就很違反直覺。還有,生物之間的「平衡」也是一個很有趣的議題。我一直覺得,地球上的生物圈就像一個巨大的精密儀器,各種生物各司其職,共同維持著一個相對穩定的狀態。但這種平衡是怎麼來的?是天擇的結果?還是演化上的巧合?我希望這本書能夠提供一些更具體的例子和解釋,讓我理解其中的邏輯。另外,「互利」的部分,我認為是整個系列中最具挑戰性的。畢竟,自然界裡有這麼多生物,要怎麼才能讓大家都能「互利」?難道沒有競爭和掠食嗎?我希望作者能夠在這方面提供一些新的觀點,不要只是簡單地描述生物之間的合作。我更希望看到作者能夠引導讀者思考,從生物界的共生、平衡、互利中,能為我們人類社會帶來哪些啟發,幫助我們更好地理解和處理我們所面臨的各種問題。

评分

收到《觀念生物學4:共生.平衡.互利(全新修訂版)》這本書,我最大的感受就是期待。過去幾年,我一直都很關注生物學的發展,特別是對生態系中各種生物之間的互動關係,我總覺得這裡面蘊含著無窮的智慧。書名中的「共生」、「平衡」、「互利」這幾個詞,正是我一直以來最感興趣的幾個主題。我總是好奇,為什麼有些生物能夠完美地合作,甚至相互依賴,而有些卻是相互殘殺?這種關係是如何建立起來的?又是如何維持的?尤其是「平衡」這個概念,我認為是生態系最迷人的地方。一個看似簡單的生態系,其實是由無數種生物、無數種互動所構成的複雜網絡,而這種網絡能夠維持長久的穩定,這本身就是一個奇蹟。我希望這本書能深入探討這種平衡的機制,以及它是如何抵禦外來的干擾,維持其穩定的。當然,「互利」也是一個非常吸引我的地方。我希望書中能有更多關於不同物種之間如何發展出互利關係的案例,例如植物與傳粉者之間的關係,或者某些細菌與宿主之間的共生。我更希望作者能夠從演化的角度,解釋為什麼這些互利關係會不斷地產生和演化。我想透過這本書,更深入地了解生物界是如何透過這些複雜的互動,來實現整體的繁榮和演化,並且能從中獲得一些對於我們人類社會的啟示。

评分

天啊,我終於拿到這本《觀念生物學4:共生.平衡.互利(全新修訂版)》了!等了好久,想說這系列的書本來就很有名,加上又是全新修訂版,肯定有新東西。我一直對生物界裡那些看似不可能卻又完美運作的合作關係感到著迷,像是苔蘚植物和真菌共生,或者珊瑚礁裡各種生物的微妙平衡,這些都讓我驚嘆不已。書名裡強調的「共生」、「平衡」、「互利」這幾個詞,就已經讓我對內容充滿期待。我特別想知道,作者在這一版裡,有沒有加入最近幾年發現的更令人震撼的共生案例?或是對原有的觀念做了什麼樣的更新與深化?畢竟科學的進步非常快速,許多過去被認為的定論,現在可能都有了新的詮釋。我希望這本書能帶我深入探討這些關係背後的機制,例如演化上的壓力如何促使生物發展出互利共生的策略,以及這種共生關係對整個生態系穩定性的影響。讀生物學相關的書籍,我最怕的就是那些枯燥乏味的條列式介紹,我希望這本書能用生動的例子和清晰的論述,讓我彷彿親臨其境,感受大自然鬼斧神工的智慧。而且,作者在「平衡」這個部分,不知道會怎麼闡述?生態系的平衡看似靜態,實則充滿了動態的調整,稍微一點擾動就可能引發連鎖反應。我期待能從書中學到更多關於生態平衡的複雜性,以及人類活動對這些平衡可能造成的破壞,進而思考我們該如何在這個星球上與其他生命共存。

评分

說實話,我對《觀念生物學4:共生.平衡.互利(全新修訂版)》這本書的評價,是基於我過去對生物學的濃烈興趣。我一直覺得,生命最迷人的地方,就在於那些看不見的連結和相互依存。書名中的「共生」、「平衡」、「互利」,這幾個詞就像磁鐵一樣吸引著我。我特別想知道,作者在這一版中,對於「共生」的定義和理解,是否有所突破?我一直對那些共生關係中,看似付出的方,最後卻能獲得更大回報的現象感到驚奇,這種「逆向思考」的演化策略,是我很想深入了解的。另外,「平衡」這個概念,對我來說,更是生態系統的靈魂。我希望作者能用更生動、更具體的方式,來解析生態系統是如何在各種力量的拉扯下,找到一種微妙的、動態的平衡。像是某些物種的數量控制,或是物種之間的能量傳遞,這些都牽涉到複雜的機制。我更希望看到,作者如何闡述這種平衡的可貴,以及一旦打破,可能引發的連鎖反應。最後,「互利」的部分,我認為是整本書的昇華。我期待能從書中看到,生物界是如何巧妙地設計出各種機制,讓不同物種在互相獲益的同時,也能促進整個生態系統的健康發展。我希望這本書不僅能讓我對生物界的奧秘有更深的認識,更能引導我思考,如何在我們人類與自然、與彼此的關係中,實踐這種共生、平衡、互利的智慧。

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