曾文水库越域引水工程计画在2009年八八风灾重创南台湾后引起相当大的关注与争论。工程施工区附近的居民指称工程自2004年开工后对当地生态造成显着的负面影响,在地环保团体认为越域引水工程与高雄县甲仙乡小林村灭村灾难之间有多项疑点并怀疑工程就是灭村元兇。然而,经济部水利署则认为是短时间内豪大雨酿成灾害。事实上早在2004年环保团体即将曾文水库荖浓溪越域引水工程计画列为「十大不永续建设与施政政策」(环境资讯中心,2004)。在工程发包前,来自高雄县荖浓溪流域的布农族人,持着「维护自然生态、尊重环境正义」、「反对曾文水库越域引水」、「誓死捍卫原住民生存权」等抗议布条到经济部陈情抗议。抗议的布农族人以「战歌」表达心中的愤怒,并在女巫的带领下,举行诅咒敌人的仪式(中央社,2004)。曾文水库越域引水工程计画牵涉当地原住民的环境权、利益与环境风险分配的公平性、环境价值冲突、专业知识的政治(politics of expertise),以及决策与程序正义等诸多争议。